A.P. Møller - Mærsks datterselskab Maersk Line er verdens største containerrederi, og i 2011 hentede gruppen 40 pct. af sine indtægter fra containerrederienheden. Maersk Line fik cementeret sin ledende position i containerfragtmarkedet med opkøbet i august 2005 af containerfragtaktiviteterne P&O Nedlloyd for 2,3 mia. euro. Tilbage i 1999 fik Mærsks containerfragtaktiviteter styrket sin platform til og fra det amerikanske marked med opkøbet af amerikanske Sea-Land for 800 mio. dollar. Seneste har Maersk Line i 2010 bestilt 20 gigantskibe de såkaldte Triple E, der har en rekordkapacitet på 18.000 teu.

Maersk Line er meget cyklisk og afhængig af konjunkturerne, som har plaget containerfragtbranchen de seneste tre år, og det blev senest bevist i regnskabet for 2011, hvor Maersk Line tabte 2,875 mia. kr. efter stærkt 2010.

Koncernen har også havnecontaineraktiviteterne APM Terminals, som er ligger tæt op af containerrederidelen. APM Terminals indbringer godt 7 pct. af koncernens omsætning.

Koncernen har betydelig indtægter og indtjening fra sine olie- og gasaktiviteter. Divisionen indhenter i omegnen af 20 pct. af koncernindtægterne, men en større del af indtjeningen, da olie- og gasaktiviteter er de mest profitabel. Divisionen indtjening er naturligvis meget afhængig af olieprisen.

I januar 2009 gennemførte Mærsk opkøbet på godt 3 mia. kr. af det svenske olietankrederi Boström, hvilke gjorde Maersk Tankers til en af de største aktører i olietankmarkedet. Maersk Tankers indbringer dog kun 2 pct. af koncernindtægterne.

A.P. Møller - Mærsks detailhandel henter godt 16 pct. af indtægter, men aktiviteterne er mindre profitable, og overskuddet fra detailhandel udgør en marginal del af koncernresultatet.